Pokemon Duel to strategia wzorowana na figurkowej grze planszowej Pokemon Trading Figure Game. W trakcie rozgrywki będziemy kontrolować własną drużynę złożoną z sześciu różnych pokemonów.
Mechanizm rozgrywki jest bardzo zbliżony do planszowej edycji Pokemonów. Każda ze stron rozpoczyna na przeciwnej mapie, a wygrywa ta drużyna, która jako pierwsza doprowadzi jednego figurkowego Pokemona do pozycji startowej przeciwnika. Niby rozgrywka wydaje się prosta i banalna, ale w rzeczywiśtości musimy dużo kombinować zwłaszcza w aspekcie blokowania figurek przeciwnika.