Chemtool jest programem do rysowania dwuwymiarowych schematów strukturalnych cząsteczek. Aplikacja została napisana w języku C z wykorzystaniem biblioteki GTK+ i przeznaczona jest dla systemów UNIX/Linux.
Aplikacja oferuje kilkanaście różnych wiązań, użytkownik ma możliwość wybrania odpowiedniej linii oraz ustawienia kąta pomiędzy wiązaniami. Oferuje ponadto szablony które można wykorzystać do rysowania bardziej zaawansowanych schematów. Niewątpliwą zaletą Chemtool jest jego intuicyjny interfejs. Praktycznie wszystkie operacje wykonuje się za pomocą kilku kliknięć myszą.
Oprogramowanie jest całkowicie darmowe (licencja GNU GPL).