WipeDisk jest niewielkich rozmiarów aplikacją do trwałego czyszczenia partycji oraz dysków twardych. Wszystkie opcje dostępne są z poziomu głównego okna programu co czyni WipeDisk przystępnym nawet niedoświadczonym użytkownikom.
Wystarczy podać dysk lub partycję, którą chcemy wyczyścić, określić metodę kasowania danych i kliknąć przycisk start. Wśród technik usuwania danych są te, które powszechnie stosują różne instytucje i organizacje takie jak NATO, czy Siły Powietrzne USA np. WipeDisk, Zero, MS Cipher, Bit Toggle czy Petera Gutmanna.
Jako, że kasowanie zawartości dysku jest nieodwracalne, przed rozpoczęciem wyświetlana jest captcha, która wyklucza pojawienia się możliwości przypadkowego skasowania zawartości złej partycji lub napędu. Program jest dostępny w wersji przenośnej i może być uruchomiony z dowolnego nośnika np. z pendrive.